А чем ИСО ущербней экспопары? Это такой же важный параметр съемки, как выдержка или диафрагма. И если вполне кошерно доверять камере выбор выдержки при съемке в режиме A или доверять диафрагму при съемке в режиме S, то почему нельзя доверить камере выбор ISO при зафиксированных вами выдержке и дифрагме?Тема об экспопаре?
Кстати, Ауто-ИСО очень удобно использовать именно в режиме M (на D3, по крайней мере).