Я снимаю в М, замер с фильтрами всегда центровзвешенный, реже - матричный (приблизительно по середине горизонта или чуть ниже). Для таких кадров в контровом смотрю на отклонение стрелки экспонометра в ВИ и позволяю ей отклоняться в плюс не более, чем на один стоп, то есть, чтобы только не потерять основные света. Их потом легко достать при конвертации.
Одним словом, нужно экспонировать по небу с учетом фильтра, то есть, чтобы небо на гистограмме прижалось к крайнему краю, но без провалов. А низ - как получится, но с фильтром он получается на два стопа светлее, чем без него, то есть вполне разумно.
На самом деле, я так много и часто снимаю подобные сюжеты в контровом, что уже особенно не задумываюсь, снимается на внутреннем автопилоте. Однако, если первый/второй кадр получились правильно по экспозиции, то ее уже можно не менять для последующих кадров (если солнце не спряталось или если не снимаете в другую сторону).
В другую сторону получается совсем иначе, посмотрите, эти два кадра сделаны почти одновременно с одной точки, но в разные стороны, и ББ тоже разный, и оба - с фильтром:
