И еще один момент - фолдер и галерея не могут иметь одинаковые названия.
Если пользоваться в Портфолио фолдерами, то да, не позволяет делать имя галереи и имя фолдера ( в окне фолдеров) одинаковыми. Хотя, если честно, то только из ваших слов попробовал это и узнал.

Действительно, раньше с таким не сталкивался. Дело в том, что с флэшки у меня сливается все в довольно простые фолдера на диске с именами в виде "год.месяц.дата" и "название либо события, либо места где снималось и что снималось". Пока все это хранится на винте и обрабатывается, или просто валяется и ждет своей очереди на запись на СиДи или ДВД, то в Портфолио это и каталогизируется точно так же по фолдерам и в окне Портфолио "Фолдер". Галереи на этом этапе создаю редко, а если создаю, то они никогда не повторяли имя реального фолдера на винте. Обычно имеют какой-то вид типа "Съемка ювелирки", в общем что-то из того, что имеет какую-то периодичность и можно объединить в одну простую тему, и чтобы по датам и названием фолдеров не выискивать тут же ювелирку. Либо это может быть галерея повторяющая и какой-то фолдер, только с пометкой "лучшее", либо пейзажи, либо "город", либо "люди" и т.п. Но вообще, действительно, на этом этапе галерями не очень пользуюсь, либо для таких мелких заметок, либо для сбора каких-то коллекций с разных дат, вот и не пересекался ни разу по именам.
Дальше же, когда записываю на СиДи или ДВД, то там уже все по другому. Честно говоря, функцию "Фолдер" в Портфоли после записи на внешние носители не использовал ни разу. Были мысли попробовать с ними придумать что-то, но так руки и не дошли, уже привычно пользоваться просто каталогами Портфоли (файлами *.fdb) и галереями в этих каталогах. Функция отображение фолдеров в Портфолио появилась только в 7-й версии, которая тоже появилась не так давно, где-то с год назад наверно, может чуть больше. А так как Портфолио пользуюсь еще с первых ее версий, то каталогов много, система уже привычна, и поменять что-то довольно сложно.

Вносятся только какие-то улучшения в связи с новыми возможностями Портфолио, но они незначительные.
На диски же пишу обычно так же последовательно по датам, накопилось на диск и записал, если не влазит на один, то разбиваю на несколько, допустим какие-то длительные поездки у которых дата размазана на пару недель.

Изредка пишу какие-то законченные тематические диски, типа "Пейзажи Крыма", но это редко, обычно это у меня есть каталог в Портфолио, допустим, с пейзажами Крыма, и там собраны превьюшки фоток под эту тему. И вот тут использую гелереи, например пейзажи того же Крыма могут делиться на морские, горные, степные, осень, лето, весна. Соответственно такому делению по необходимости и создаю галереи в каталоге. Как говорил, удобно тут то, что можно в уже готовом каталоге все довольно просто переносить или копировать из галереи в галерею, притом что все превьюшки каталога можно всегда увидеть в галерее "All Items". Плохо конечно, что галереи нельзя делать многоуровневыми, потому как те же морские пейзажи можно делить на закатные или рассветные, шторм или штиль. Потому и приходится выкручиваться создавая новый каталог исключительно для морский пейзажей, а в этом каталоге уже делить на закаты и шторма. Соответственно и для каталогов *.fdb существуют на винте свои фолдера разделяющие эти катлоги по каким-то темам и подтемам. Притом чтобы создать новый катлог из какой-то галереи уже готового каталога, то вовсе не обязательно вставлять СиДи или ДВД в привод, можно просто перетаскивать превьюшки с одного каталога в другой, точно так же как при рзделении на галереи. Так что все довольно просто вроде, без лишних заморочек. Вот разве что руками переносить эти превьшки в новый каталог не очень удобно, был бы какой-то автомат было бы удобней. С другой стороны, выбрал галерею, а вней все превьшки отметил, да и перетащил в новый каталог, дело нескольких секунд.
В общем, принцип наверно понятен, но детали тут уже кому как удобней, в зависимости от предпочтений в съемке, от объема съемок по какой-то теме и ее подтемам. Много ли фотографий по этой теме, или ее можно объединить пока с какой-то другой в один общий каталог и разнести по разным галереям, либо все же создать разные каталоги, и в них еще делить на галереи. Действительно, тут уже каждый, наверно, вырабатывает свою какую-то удобную для него систему.
Если будут вопросы, спрашивайте, постараюсь ответить.