Отдельная операция по выравниванию и отдельная - по кропу.
Копировать настройки, насколько я знаю, возможности нет.
Обработать группу файлов можно выделив их и применив одинаковые настройки, а потом отправить на конвертацию.
Это, все-таки, базовый конвертер, и, вообще говоря, он даже называется вьювером.