Небольшая реплика по общей концепции бэкапов:
Утилиты простой синхронизации каталогов, конечно, весьма полезные штуки. Но они как мне кажется, не являются полноценным бэкапом. Потому что полноценный бэкап умеет в историю версий сохраняемых файлов, а не только переписывать файл в его последнем состоянии куда-то. Особенно если надо "откатить архивацию" на определённую дату. Уверен что большинство присутствующих понимает этот момент, и пишу эту реплику исключительно для формирования полноты вопроса для тех, кто только начинает выстраивать систему архивирования своих данных. Впрочем, даже простая односторонняя синхронизация - это уже лучше чем ничего
_______
Конкретно по запросу темы:
Если простой синхронизации нескольких отдельных каталогов на внешний жесткий диск достаточно, то allwaysync - вполне уютна в этом отношении. Частично умеет в версионность, пусть не сильно удобно, но зачатки имеются. Имеет собственный планировщик с весьма широкими настройками, включая "начать синхронизацию при присоединении внешнего диска", что для некоторых сценариев работы удобно. Также умеет отслеживать именно конкретный подсоединяемых диск, даже если у него поменяется логическая буква диска (скажем, с F:\ на G:\). Довольно быстро обрабатывает - анализирует расхождение и копирует новое и измененное - в массивах из сотен тысяч файлов, не затыкаясь при этом. Бесплатна до определенных объемов копирования (для личного использования, лимитом в 40000 файлов за 30 дней). Если захочется оплатить лицензию не имеющую ограничений по объемам, то цена $26 за бессрочную лицензию. Я брал её лет десять назад за примерно $10, и до сих пор те купленные ключи работают на все следующие версии программы, которые вышли за всё это время.